Les collections offrent un large éventail de pratiques de l'écrit au cours des siècles. 
Par définition, un manuscrit est copié à la main. Au Moyen-Âge et jusqu'à l'arrivée de l'imprimerie en Europe, tous les livres sont manuscrits. Ils sont réalisés dans des ateliers de copistes où chaque tâche est distribuée. Le codex, inventé dans les premiers siècles de l'ère chrétienne, remplace peu à peu le rouleau (ou volumen).

Une variété de supports :
La médiathèque conserve des manuscrits du Moyen-Âge sur parchemin, des exemplaires particuliers où parchemins et papiers ont été utilisés dans un même ouvrage, un manuscrit venant d'Asie copié sur feuille de latanier, un papyrus original trouvé avec une momie égyptienne et d'un don fait par un bibliothécaire au XIXe siècle...

Certains documents comme les livres de mémoires sont copiés sur plusieurs années et comportent souvent des écritures différentes, faites par plusieurs mains. 

Les collections ont été enrichies par des dons successifs. On y trouve des oeuvres originales et des manuscrits d'écrivains écrits au XIXe et XXe siècle.
A la mort du sculpteur Célestin Manalt, l'association des Amis de l'artiste donne des carnets d'esquisses et de notes à la bibliothèque municipale.
Plus récemment en 2017, les petits-enfants de l'écrivain et homme de lettres Josep Sebastià Pons donnent à la médiathèque des manuscrits originaux de leur grand-père.

La médiathèque conserve les recueils de notes de plusieurs érudits et historiens qui ont travaillé sur l'histoire du Roussillon : 
D.M.J. Henry

Consulter le Cartulaire

Au Moyen-Age, le seul moyen de transmettre un texte est de le copier à la main. D’abord dans les monastères (scriptoria) puis dans les villes, les ateliers de copistes répondent à la demande croissante des lecteurs. Les ateliers optimisaient les pratiques et répartissaient les tâches en plusieurs étapes :
préparation du support (parchemin puis papier) 
fabrication des encres et des couleurs
partage du travail entre ceux qui supervisaient le texte et ceux qui l’écrivaient,
écritures à plusieurs mains : copistes, rubricateurs, correcteurs,
décors par les enlumineurs et les miniaturistes
reliure pour protéger le précieux document.

Quelques ouvrages, parmi les plus prestigieux de la collection, sont des manuscrits enluminés. Ils montrent les pratiques des copistes, la distribution du travail et la finesse d'exécution de différentes mains : copistes, rubricateurs, enlumineurs, miniaturistes, relieurs qui laissent chacun leur savoir-faire et leur empreinte.

A la découverte de quelques manuscrits :

Un texte des Evangiles du XIIe siècle
Une traduction en catalan de Valère Maxime au XIIIe siècle
Un missel copié en 1424 pour Jérôme d'Ochon évêque d'Elne
Le missel des Merciers et des peintres (1490-1492)
Un diplôme d'entrée au monastère Sainte Claire de Perpignan
Le livre dit des Quatre Clous de l'université de Perpignan


Des livres de mémoire dont pour le 17e siècle, les Mémoires du notaire Pere Pasqual

Des originaux manuscrits  ont été donnés à la médiathèque par des écrivains ou leurs héritiers. Ce sont parfois des oeuvres originales qui n'ont jamais publiées ;
ou des oeuvres en gestation, avec plusieurs versions, des ratures, des repentirs, des annotations, des retouches et des dessins parfois ; des corrections de textes imprimés juste avant leur publication définitive.
Manuscrits de Josep Sebastià Pons
Exemplaire des "Recorts del Rosselló" de Pere Talrich avant édition définitive.

On trouve de la correspondance : lettres de l'abbé Casamajor.

La médiathèque conserve aussi des textes tapuscrits écrits sur de fragiles pelures. Ils sont numérisés pour des raisons de conservation car le support du document est très fragile et l'encre très pale.
Ils sont numérisés mais ne peuvent pas être mis en ligne car ils ne sont pas dans le domaine public. Ils sont consultables sur place. Textes tapuscrits inédits d'Albert Janicot.